Ο ΝΕΟΝ στηρίζει το Εθνικό Μουσείο Σύγχρονης Τέχνης από το 2012, και έχει δεσμευθεί να συμβάλλει περαιτέρω στη λειτουργία και τη βιωσιμότητά του.
Το πρόγραμμα που είχε ανακοινωθεί το 2015 προϋποθέτει τη λειτουργία του Μουσείου, καθώς αναφέρεται σε πραγματοποίηση εκθέσεων και εκπαιδευτικών προγραμμάτων. Η υλοποίηση των δράσεων αυτών θα επανεξεταστεί μετά την έναρξη λειτουργίας του ΕΜΣΤ.

Το πρόγραμμα του ΝΕΟΝ για τη στήριξη του ΕΜΣΤ περιλαμβάνει:

Εμπλουτισμός της μόνιμης συλλογής του ΕΜΣΤ
Στην τριετία 2012-2015, ο ΝΕΟΝ στήριξε το ΕΜΣΤ µε δύο ετήσια προγράμματα για τον εμπλουτισμό της μόνιμης συλλογής του Μουσείου. Ο ΝΕΟΝ προσέφερε 50.000 ευρώ ετησίως για αγορά έργων επιλογής του Μουσείου από τη διεθνή έκθεση Frieze Art Fair.
Το 2015 αγοράστηκαν τα έργα των Joana Hadjithomas & Khalil Joreige, Ι stared at beauty so much, 2013, Waiting for the Barbarians και Francis Alÿs, από τη σειρά Camgun, 2008.
Παράλληλα, κάθε χρόνο δωρίζεται ένα νέο έργο επιλογής του Μουσείου, µε τη συνεργασία των οργανισμών Outset και International Production Fund.

Εκθέσεις-Εκπαίδευση
Το εκθεσιακό πρόγραμμα συμπεριλαμβάνει την υλοποίηση ετήσιου θεσμού που αφορά στην ανάθεση σε διεθνείς καλλιτέχνες να δημιουργήσουν ένα έργο που θα εκτίθεται στη στέγη του ΕΜΣΤ, με επιµελητεία του ΕΜΣΤ. Επίσης, την οργάνωση και χρηματοδότηση περιοδικών εμβληματικών εγκαταστάσεων από διεθνή μουσεία και τη Συλλογή ∆.∆ασκαλόπουλου, ανά τακτά χρονικά διαστήµατα στο ΕΜΣΤ.

Το εκπαιδευτικό πρόγραμμα περιλαμβάνει: τη χρηματοδότηση θέσης ‘ΝΕΟΝ Επιμελητής Εκθέσεων’ καθώς και θέση ‘ΝΕΟΝ Επιμελητής Εκπαίδευσης’, το Εκπαιδευτικό Πρόγραμμα ΝΕΟΝ “Mentor a Curator”, τον εμπλουτισμό της βιβλιοθήκης του ΕΜΣΤ αλλά και τη συνδιαµόρφωση εκπαιδευτικών προγραμμάτων στο ΕΜΣΤ για τα σχολεία.